Shalhoub je rođen kao Anthony Marcus Shalhoub u Green Bayu u Wisconsinu, gdje je i odrastao. Njegov otac Joe Shalhoub emigrirao je iz Libanona u Ameriku kao siroče u dobi od deset godina. Kasnije je oženio Tonyjevu majku Helen koja je bila druga generacija Amerikanaca porijeklom iz Libanona te osnovao obiteljsko poduzeće, počevši od skromne prodavaonice u centru Green Baya . Tonyjeva braća i sestre upoznali su ga s kazalištem. Kada je Tonyju bilo šest godina, jedna od njegovih starijih sestara nagovorila ga je da bude statist u srednjoškolskoj predstavi 'Kralj i ja'.
"Sjećam se da je moja starija sestra glumila u predstavi. Jedino što znam da mene nitko nije pitao želim li glumiti, već su svi glumci iz predstave pozvali svoju mlađu braću i sestre da glume djecu. Tada sam prvi put stao na pozornicu . Taj osjećaj je bio divan i u meni se probudio adrenalin. Shvatio sam da želim ovo ponoviti", izjavio je glumac.
Kriminalističku humornu dramu "Monk" gledajte vikendom od 22:15 na RTL2.