Jonathan Togo rođen je 25. kolovoza 1977. godine u obitelji zanimljivog podrijetla. Majka mu je talijansko-irskih korijena, dok je otac Židov ukrajinskog podrijetla. Originalno obiteljsko prezime Tonkavivevu prošlosti je skratio jedan od Jonathanovih predaka jer je htio upečatljivije ime za svoj novi biznis.
Togo je pohađao hebrejsku školu iu srednjoj se bavio hrvanjem. Dok je bio na fakultetu, svirao je saksofon i gitaru u punk/rock/ska bendu Skabba The Hut. Bend se raspao, ali su dva nekadašnja člana nastavili karijeru u uspješnom rock-bendu The Bravery.
Prije uloge u CSI-ju, koja ga je proslavila, pojavljivao se u serijama poput 'Sutkinja Amy' i 'Zakon i red', a imao je i manju ulogu u filmu 'Mistična rijeka'. Zanimljivo je što se 2008. Jonathan okušao u pisanju i režiranju web-serije 'My Best Friend is my Penis' za portal Atom.com. Nakon toga je uslijedila uloga u još jednoj web-seriji zvanoj 'Casted: The Continuing Chronicles of Derek Riffchyn, Greatest Casting Director in the World. Ever', gdje je igrao glavnu ulogu Dereka – temperamentnog i ponekad nasilnog direktora castinga,Togov najbolji prijatelj iz stvarnog života, JustinLong, igra asistenta Scotta.
Togo je od 2013. godine u braku s glumicom Diorom Bairdi imaju dvoje djece.