Nakon parlamentarnih izbora 2011. godine, Slavko Linić postaje ministar financija u Vladi Zorana Milanovića.
Kao ministar često je bio u sukobu s različitim lobističkim skupinama zbog uvođenja financijske discipline u gospodarstvo, provedbe fiskalizacije - projekta usmjerenog na suzbijanje utaje poreza - i predstečajnih nagodbi, uvedenim kako bi se ubrzao proces restrukturiranja prezaduženih kompanija.
Inzistiranjem na uvođenju poreza na nekretnine, Linić je često bio i izvor sukoba sa SDP-ovim koalicijskom partnerom HNS-om.
Unatoč tome, građani ga, među ostalim zbog donošenja zakona kojim su smanjene kamate na bankarske kredite u švicarskim francima, u anketama navode kao jednog od najpopularnijih hrvatskih političara.
